Gene Probe

Example 3 page 1

Output data Comparison of GeneMark.hmm

with GeneBank annotation, GenScan and FGenesH output data
Human DNA sequence: AF023268

page 2: Summary

Denotes GeneBank annotation
Denotes result congruent to GeneBank
Denotes result opposing GeneBank and at least one other program
Denotes result which matches all other programs but does not match GeneBank annotation

GeneBank GeneMark.hmm GeneScan
I+15401687I+15401687I+15401687
+18071877+18071877+18071877
+21952314+21952314+21952314
+24062524+24062524+24062524
+26162697+26162707+26162697
      T+27322764
T+27892794T+27892865   
T-33253552T-33253552T-33253552
-36383772-36383772-36383772
-38604183-38604183-38604183
I-43014648I-43014648-43014575
      -47704848
      I-63056373
I+1056010716I+1056010716I+1056010716
+1080810937+1080810937+1080810937
T+1103911573T+1103911573T+1103911573
   T-1206012089   
S-1216012426I-1218112426S-1216012426
T-1331513437I+1331513437I+1331513437
-1352313600+1352313600+1352313600
-1373313798+1373313798+1369113798
-1389613955+1389613955+1389613955
-1409114147+1409114198+1409114147
-1427914408+1427914408+1427914408
-1455414621+1455414621+1455414621
-1469314860+1476814860   
-1495415001+1495415001+1495415001
-1513915360+1513915315+1513915315
-1540915519+1540915519+1540915519
-1578215877+1578215877+1578215877
-1597916050+1597916050+1597916050
-1613516171+1613516171+1613516171
-1625616305+1625616290+1625616290
I-1640616480T+1640616480   
I+1833518424I+1811818368+1812418357
   +1853418558   
+1863018698+1864218698+1863018698
+1884618952+1884618952+1884618952
+1904319085+1904319085+1904319164
T+1916919375+1916919342+1919419342
   +1948419559   
   +1964819786   
   +1988719951+1988719951
   T+2010220748T+2010220748
I+2140221830I+2140221830I+2140221830
+2207222503+2207222503+2207222371
+2259822762+2259822762+2259822762
+2283822925+2283822925+2283822925
+2300223150+2300223150+2300223150
+2324723328+2324723328+2324723328
+2341223513+2341223513+2341223513
T+2362924287T+2362924287T+2362924287
I+2811128256I+2811128256I+2811128256
+2841328476+2841328476+2841328476
+2856828657+2856828657   
+2874428800+2874428800   
+2889828946+2889828946   
+2903929115+2904529115   
+2924529379+2925429379   
+2964529812+2964529812+2964529812
+3001630126+3001630126+3001630126
+3020730361+3020730361+3020730361
+3045230527+3045230527   
+3063830755+3063830755+3061630755
+3084731232+3084731232+3084731020
      +3103331232
+3135131533+3135131533+3135131533
+3162231741+3162231741   
   +3181431844+3178431844
T+3184531892      
   +3262332704+3257532704
   +3278732850+3278732850
   +3306533144T+3306533148
   +3320633252   
   +3345233541   
   T+3392033990   
T-3419934325T-3419934325T-3419934325
-3441034528-3441034528-3441034528
-3463234870-3463234864-3463234870
-3496735092-3496735065-3496735092
-3551636600-3551636600-3550136600
-3668736889-3668736889-3668736889
I-3696737257-3696737243I-3696737257
T-3932139753-3932539753T-3932139753
-4002640169-4002640169-4002640169
I-4028640722I-4028640722I-4028640722
S-4601746325S-4601746325S-4601746325
T-5112451293I+5112451293I+5112451293
   +5144151600+5144151600
-5178451934+5172551934   
-5201952269+5201952269+5201952269
I-5235752528T+5235752528+5235752517
I+5300953460I+5300953460+5298653287
T+5355653676+5355653631   
   +5375353860+5375353860
   +5394654176+5394654176
I+5428254400+5428254400+5428254400
+5449754875+5449754955+5449754875
   +5503755145   
T+5526355799+5526355795+5526355795
   +5589356057+5588756057
   +5615156332T+5615156352
   +5702857138   
   T+5730957397   
I+5806758373I+5806758373I+5806758373
+5846958536+5846958536   
+5862858706+5862858706   
+5877958861+5877958861+5877958861
+5895059013+5895059001+5895059001
+5922459309+5922459309+5922459309
+5946859534+5946859534+5946859534
+5979759876+5979759876+5979759876
T+5997160111+5997160035+5997160035
   +6017160420+6017160420
   +6054260688+6054260688
   +6076660954+6076660922
   T+6105761122   
      +6162561696
I+6198762138I+6198762138+6198162138
+6223062269+6223062269   
+6235262399+6235262399   
+6249062575+6249062575+6249062575
+6265362781+6265362781+6265362781
T+6287863115T+6287863115T+6287863115
   T-6335963410   
T-6347963895-6349563895T-6347963895
-6397865206-6397865133I-6397865204
I-6529365893I-6528965893S-6526765893
S+6644467292S+6644467292S+6644467292
I+6886469373I+6886469373I+6886469373
+6976770262+6976770262+6976770262
+7035070450+7035070450+7035070450
+7054470633+7054470633+7054470633
+7072970853+7072970853+7072970853
T+7118371321T+7118371321T+7118371321
S+7209673007S+7209673007S+7209673007
T-7340673596T-7340673596T-7340673596
-7367774036-7367774036-7367774036
I-7411674557I-7411674557I-7411674557
   I+7542375503   
S+7597076164T+7594976164T-7603176122
T-7655476631T-7662776923   
      -7667476923
-7692377023      
   -7702377160-7702377160
-7716077262      
   -7726277411-7726277411
-7741177633-7750277562   
      -7763377675
-7767577763      
   -7776377828-7776377828
-7782877938      
   -7793878396-7793878396
-7839678500      
   -7850078799-7850078958
-7879978916      
   -7891679044   
-7904479139      
   -7913980120-7913980120
-8012080223      
   I-8022380529I-8022380529
S+8116581539S+8116581539S+8116581539
I+8340983737I+8340983737I+8340983737
+8394884105+8394884130+8394884105
   +8426184442   
+8454384779+8454384779+8454384779
+8501385122+8501385122+8501385122
+8520885285+8520885285+8520885285
+8536685451+8536685472+8536685472
+8561085704+8561085704+8561085704
+8576185919+8578585915+8576185915
   +8602986132+8602986132
   +8622886305   
   +8639586473+8643786473
   +8658686754+8658686754
+8695187021+8695187021+8694086983
+8720387283+8720387283+8720387283
+8736387433+8737287433+8736387433
+8768687782+8768687782+8768687782
T+8788287941+8788287941+8788287941
Gene Probe, Inc.
1106 Wrights Mill Court
Atlanta, GA 30324

PH: +1 (404) 579 - 2975
FX: +1 (404) 255 - 2067
Technical Support
Licensing Support

Website by psws.com